蛇口中学创建于1970年，开办时定性为两年制高中，当时校舍尚无，租借湾厦村的一间仓库做为校舍，吴湛担任校长，有3名教师，他们是殷干勋、徐志华、郑耀辉，开设一个班，有29名学生。
蛇口学校在2003年由两所广东省一级学校--蛇口小学(创办于1955年)和蛇口中学(创办于1970年)合并而成的九年一贯制学校。校园面积3万5千平方米，建筑面积2万1千平方米。现有59个教学班，其中小学部29个班，中学部30个班。学生人数2757人(其中小学部1389人、中学部1368人)，教职工203人。有60间教室，操场1个，体育馆1间，多媒体室6间，实验室及科学探究室8间。
